HTS-Net: An integrated regulome-interactome approach for establishing network regulation models in high-throughput screenings.
Rioualen C, Da Costa Q, Chetrit B, Charafe-Jauffret E, Ginestier C, Bidaut G
Plateforme de Bioinformatique Intégrative Cibi
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Eddy Pasquier a obtenu la médaille de Bronze du CNRS -
La plateforme Cibi offre un large panel d’expertise en bioinformatique (intégration de données, développement d’analyse biologiques) et développe ses propres pipelines bioinformatique.
Nous développons également des bases de données à visée biologique pour le stockage et la gestion de données.
Voici nos expertises:
- Analyse et intégration de données de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) (Chip-Seq, RNA-Seq, SC-RNA-Seq, analyse de variants à visée recherche et diagnostique)
- Cytométrie de flux et cytométrie de masse.
- Protéomique
- Développement de pipelines bioinformatique et de bases de données (Python, R, Bioconductor, RShiny, Django, PostgreSQL, etc…)
- Collaboration sur projet (INCa, ANR, ARC, etc…)
Nous accueillons des stagiaires en master et école d’ingénieurs.
les publications de l‘équipe
Epigenetic down-regulation of the HIST1 locus predicts better prognosis in acute myeloid leukemia with NPM1 mutation.
Garciaz S, N'guyen Dasi L, Finetti P, Chevalier C, Vernerey J, Poplineau M, Platet N, Audebert S, Pophillat M, Camoin L, Bertucci F, Calmels B, Récher C, Birnbaum D, Chabannon C, Vey N, Duprez E
Nidogen-1 Contributes to the Interaction Network Involved in Pro-B Cell Retention in the Peri-sinusoidal Hematopoietic Stem Cell Niche.
Balzano M, De Grandis M, Vu Manh TP, Chasson L, Bardin F, Farina A, Sergé A, Bidaut G, Charbord P, Hérault L, Bailly AL, Cartier-Michaud A, Boned A, Dalod M, Duprez E, Genever P, Coles M, Bajenoff M, Xerri L, Aurrand-Lions M, Schiff C, Mancini SJC