Immunomonitoring

La plateforme d’Immunomonitoring en Cancérologie (PIC) située sur le campus de l’Institut Paoli-Calmettes est intégrée au Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille et est affilié à l’IPC, l’Inserm, le CNRS, Aix-Marseille Université. Labellisée IBiSA depuis 2008 et certifié ISO 9001 (2015) et NF X50-900 (2016), la plateforme est ouverte à la communauté scientifique académique et industrielle dans le cadre de collaborations et/ou de prestations de projets liés à la cancérologie et à l’immunologie.

Compétences et expertise :

• Analyse du microenvironnement tumoral dans le cadre de projets de recherche fondamentale et préclinique sur des modèles expérimentaux et chez l’Homme
• Identification des mécanismes impliqués dans l’apparition des altérations de l’immunité innée et adaptative liées aux cancers
• Développement préclinique de biothérapies
• Développement et validation de biomarqueurs (diagnostiques, pronostiques et prédictifs de réponse et de toxicité) dans les hémopathies et tumeurs solides traitées par immunothérapie
• Suivi des réponses anti-tumorales sous immunothérapie (anticorps monoclonaux, vaccination, greffe) :
  • Cartographie des populations immunes et des cibles thérapeutiques
  • Suivi de la fixation des anticorps thérapeutiques sur les populations immunitaires après fixation
  • Monitoring de l’état cellulaire consécutif à la fixation d’anticorps thérapeutiques
  • Identification de checkpoints alternatifs pour les combinaisons d’immunothérapie
  • Elucidation des mécanismes de résistance aux immunothérapies

Activités :

• Manipulation des prélèvements de patient (sang, moelle et tissu)
• Dosage de cytokines, chimiokines et biomarqueurs solubles (ELISA, Luminex)
• Dosage ARN et/ou ADN, extraction d’ARN et/ou ADN
• Réverse transcription et RQ-PCR
• Génotypage
• Production de plasmides
• Simple ou double expansion de lymphocytes NK et lymphocytes Tgd
• Culture 3D (sphéroïdes, organoïdes)
• Immunofluorescence (IF) et RNAscope
• Phénotypage en cytométrie multiparamétrique (cytométrie conventionnelle, cytométrie spectrale et cytométrie de masse) pour la caractérisation des populations cellulaires
• Essais fonctionnels in vitro (cytotoxicité, prolifération, production de cytokine)
• Transcriptomique, scRNAseq
• Analyse statistique (corrélation entre les paramètres biologiques et cliniques)
• Analyse bio-informatique de données de forte dimensionnalité (machine learning)

Equipements :

• Pièce de culture (P1, P2) avec poste de sécurité microbiologique (PSM)
• Incubateur à CO2 pour la culture cellulaire (Heraeus)
• Centrifugeuses (Thermoscientific)
• Microscopes inversés (Olympus)
• Cytomètre en flux : canto II (BD Biosciences)
• Cytomètre de masse : Helios (Standard Biotools)
• Luminex Bio-Plex 200 (Bio-Rad)
• Bio analyseur (Agilent)
• Four à hybridation (Bio-Techne)
• Spectro-fluo-photomètre (proteigene)
• Différents petits équipements : gentleMACS Dissociator (Miltenyi), balance de laboratoire, …

Publications Clés

CD25high Effector Regulatory T Cells Hamper Responses to PD-1 Blockade in Triple-Negative Breast Cancer.

S Fattori, A Le Roy, J Houacine, L Robert, R Abes, L Gorvel, S Granjeaud, MS Rouvière, A Ben Amara, N Boucherit, C Tarpin, J Pakradouni, E Charafe-Jauffret, G Houvenaeghel, E Lambaudie, F Bertucci, P Rochigneux, A Gonçalves, A Foussat, AS Chretien, D Olive. Cancer Research 2023.

Anti-HVEM mAb therapy improves antitumoral immunity both in vitro and in vivo, in a novel transgenic mouse model expressing human HVEM and BTLA molecules challenged with HVEM expressing tumors.

Demerlé C, Gorvel L, Mello M, Pastor S, Degos C, Zarubica A, Angelis F, Fiore F, Nunes JA, Malissen B, Greillier L, Guittard G, Luche H, Barlesi F, Olive D. J Immunother Cancer. 2023.

Mass cytometry reveals classical monocytes, NK cells and ICOS+ CD4+ T cells associated with pembrolizumab efficacy in lung cancer patients.

P Rochigneux, A Lisberg, A Garcia, S Granjeaud, A Madroszyk, S Fattori, A Gonçalves, R Devillier, P Maby, N Salem, L Gorvel, B Chanez, J Gukasyan, J Caroll, J Goldman, AS Chretien, D Olive, E Garon. Clinical Cancer Research 2022.

High throughput mass cytometry staining for deep phenotyping of human NK cells (invited article).

A Ben Amara, MS Rouviere, S Fattori, J Wlosik, E Gregori, N Boucherit, PL Bernard, J Nunès, N Vey, H Luche, L Gorvel, D Olive, AS Chretien. STAR Protocols 2022.

Tumor associated macrophage in HPV+ tumors: Between immunosuppression and inflammation.

Gorvel L, Olive D. Semin Immunol. 2023.

High-dimensional mass cytometry analysis of NK cell alterations in Acute Myeloid Leukemia identifies a subgroup with adverse clinical outcome.

AS Chretien, R Devillier, S Granjeaud, C Cordier, C Demerle, N Salem, J Wlosik, F Orlanducci, E Gregori, M Paul, P Rochigneux, T Pagliardini, M Morey, C Fauriat, N Dulphy, A Toubert, H Luche, M Malissen, D Blaise, J Nunès, N Vey, D Olive. PNAS 2021.

Development of ICT01, a first-in-class, anti-BTN3A antibody for activating Vγ9Vδ2 T cell-mediated antitumor immune response.

De Gassart A, Le KS, Brune P, Agaugué S, Sims J, Goubard A, Castellano R, Joalland N, Scotet E, Collette Y, Valentin E, Ghigo C, Pasero C, Colazet M, Guillén J, Cano CE, Marabelle A, De Bonno J, Hoet R, Truneh A, Olive D, Frohna P. Sci Transl Med. 2021.

3D Tumor Models and Their Use for the Testing of Immunotherapies.

Boucherit N, Gorvel L, Olive D. Front Immunol. 2020.