Vésicules extracellulaires : mécanismes de signalisation et ingénierie thérapeutique

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Le Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille fête ses 50 ans ! -

En bref

L’objectif de notre recherche est d’identifier de nouveaux mécanismes de signalisation cellulaire importants en cancérologie et de proposer des approches diagnostiques et thérapeutiques innovantes.

Nous étudions de nouvelles voies de signalisation intracellulaire et de communication intercellulaire et leurs potentielles applications dans le domaine de la cancérologie. Nos travaux sont axés sur les protéines d’échafaudage (héparan sulfate protéoglycanes et protéines à domaines PDZ) et sur les phosphoinositides, deux groupes de molécules qui jouent un rôle important dans l’organisation spatio-temporelle de la signalisation intracellulaire.

Nous étudions en particulier leur effet sur la demi-vie des récepteurs de signalisation, leur rôle dans la communication intercellulaire et leur impact sur les processus nucléaires. Nous espérons ainsi découvrir de nouvelles voies thérapeutiques.

En détail

Champs d’investigation : Signalisation cellulaire, protéines d’échafaudage, lipides de signalization, compartimentalisation de la membrane, processus nucléaires, biologie cellulaire, biochimie, modèles animaux, cancer, découverte de nouvelles drogues.

In memory of Suzanne Eaton

Principaux projets de recherche

Les cellules vivantes présentent des voies de signalisation complexes médiées par des réseaux de protéines spécialisées dans la transduction du signal. Le câblage des voies de signalisation, ou la relation signal-effet, sont coordonnés par les protéines d’échafaudage. Ces protéines contiennent de multiples domaines d’interaction et fonctionnent en organisant des plateformes qui recrutent des molécules de signalisation spécifiques et leurs partenaires d’amont ou d’aval.

Nous nous focalisons sur deux classes de protéines d’échafaudage, les syndecan heparan sulfate protéoglycanes et les protéines à domaines PDZ, et sur une classe de lipides, les phosphoinositides. Les syndecans sont des structures d’échafaudage extracellulaires et sont des co-récepteurs d’une pléthore de facteurs de croissance (par exemple EGF, Wnt, BMP) ou et de molécules d’adhésion (par exemple la fibronectine, le collagène). Les protéines à domaines PDZ fonctionnent comme des modules d’interaction qui reconnaissent de courtes séquences à l’extrémité C terminale de récepteurs transmembranaires. En outre, nous avons montré que les protéines PDZ peuvent également interagir avec les phosphoinositides, des lipides qui contrôlent la compartimentalisation subcellulaire et certains évènements de signalisation à la membrane ou dans le noyau. Nous poursuivons actuellement trois lignes de recherche : (i) clarifier le rôle de la voie syntenin-syndecan dans les processus d’endocytose, d’exocytose, de développement et de cancérogenèse, (ii) clarifier la fonction des interactions lipides-PDZ en particulier dans le noyau, et (iii) comprendre comment les protéines PDZ intègrent les signaux protéiques et lipidiques au niveau moléculaire. Nous espérons ainsi (i) identifier des mécanismes importants pour l’apparition et le développement de pathologies, en particulier du cancer, (ii) découvrir de nouveaux aspects de la biologie des protéines PDZ et contribuer à élucider les vois de signalisation nucléaires des phosphoinositides, et (iii) proposer de nouvelles stratégies pharmacologiques.

Approches technologiques

https://www.molbiolcell.org/doi/abs/10.1091/mbc.E20-08-0566Nous utilisons une combinaison de techniques de biologie structurale, de biophysique, de biologie cellulaire et des études sur des modèles animaux. Nous avons une expérience assez large des techniques standard de biologie moléculaire et cellulaire (en particulier la microscopie à fluorescence confocale et d’imagerie in vivo), de biochimie (en particulier la spectroscopie à résonnance plasma de surface/Biacore) et de modèles animaux (poisson zèbre et souris). Nous avons des collaborations en cours pour des études de RMN, de cristallisation, de découvertes de nouvelles drogues et de cancérologie.

GRANTS (2016-en cours)

Fondation de France ZIMMERMANN-LEBLANC 2023-2025: Investigating the importance of syntenin-dependent exosomal exchanges for AML resistance and relapse

CANCEROPOLE EMERGENCE LEBLANC 2022: Investigating the importance of syntenin-dependent exosomal exchanges for AML resistance and relapse

ANR-18-CE13-0017-01_ZIMMERMANN Date Début du projet : 01-JAN-19 – Date de Fin : 30-JUN-23 Role of tetraspanin-syndecan-PDZ webs in the molecular and functional heterogeneity of extracellular vesicles. Rôle des réseaux tétraspanines-syndécanes-PDZ dans l’hétérogénéité moléculaire et fonctionnelle des vésicules extracellulaires

MARIE-CURIE EGEA-JIMENEZ EXOGENESIS_N°747025_U1068 Date Début du projet : 01-DEC-18 – Date de Fin : 30-NOV-20

LNCC_ZIMMERMANN_U1068 Date Début du projet : 01-JAN-18 – Date de Fin : 31-DEC-23 Réseaux moléculaires PDZ-syndécanes-lipides : fonctions dans le trafic membranaire et implications en cancérologie

LNCC EGEA-JIMENEZ POST-DOC FELLOWSHIP 01-JAN 17- 30-NOV-18

INCA PLBIO 2012-2017 BORG (ZIMMERMANN PARTNER) Etude moléculaire et ciblage de VANGL2, un récepteur de la voie WNT/PCP, dans les cancers du sein Molecular study and targeting of the WNT/PCP VANGL2 receptor in breast cancer

ARC FIXE 2016 ZIMMERMANN Rôle des exosomes de l’hôte dans le développement de la leucémie aigue myéloïde Contribution of host exosomes to Acute Myeloid Leukemia Development

ITN PDZNET CE_675341_PDZnet_U1068 Date Début du projet : 01-SEP-16 – Date de Fin : 31-AOU-20